Protein–RNA interactions for Protein: P24046

GABRR1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR1P24046 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GABRR1P24046 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GABRR1P24046 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms