Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PRKACBP22694 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms