Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CXCL3P19876 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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CXCL3P19876 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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CXCL3P19876 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CXCL3P19876 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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