Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CTPS1P17812 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms