Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRIM27P14373 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRIM27P14373 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms