Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC5A1P13866 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC5A1P13866 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC5A1P13866 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC5A1P13866 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC5A1P13866 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC5A1P13866 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC5A1P13866 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC5A1P13866 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC5A1P13866 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC5A1P13866 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC5A1P13866 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLC5A1P13866 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms