Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HLA-DOBP13765 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms