Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RLBP1P12271 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RLBP1P12271 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms