Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCL3P10147 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCL3P10147 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCL3P10147 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms