Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GLI4P10075 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GLI4P10075 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GLI4P10075 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms