Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PKHD1P08F94 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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