Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MSMBP08118 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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MSMBP08118 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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MSMBP08118 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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MSMBP08118 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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MSMBP08118 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MSMBP08118 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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MSMBP08118 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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MSMBP08118 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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MSMBP08118 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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MSMBP08118 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MSMBP08118 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMBP08118 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMBP08118 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMBP08118 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMBP08118 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMBP08118 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMBP08118 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMBP08118 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMBP08118 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMBP08118 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMBP08118 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
MSMBP08118 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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