Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CENPBP07199 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CENPBP07199 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CENPBP07199 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CENPBP07199 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms