Protein–RNA interactions for Protein: P05165

PCCA, Propionyl-CoA carboxylase alpha chain, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCCAP05165 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCAP05165 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCAP05165 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCAP05165 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCAP05165 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCAP05165 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCAP05165 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCAP05165 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCAP05165 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCAP05165 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCCAP05165 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCCAP05165 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCCAP05165 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCCAP05165 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCCAP05165 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCCAP05165 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCCAP05165 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCCAP05165 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCCAP05165 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCCAP05165 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCCAP05165 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCCAP05165 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms