Protein–RNA interactions for Protein: P01036

CST4, Cystatin-S, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST4P01036 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CST4P01036 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CST4P01036 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CST4P01036 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CST4P01036 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CST4P01036 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CST4P01036 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CST4P01036 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CST4P01036 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CST4P01036 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CST4P01036 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CST4P01036 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CST4P01036 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms