Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALX3O95076 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALX3O95076 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALX3O95076 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALX3O95076 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALX3O95076 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALX3O95076 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALX3O95076 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALX3O95076 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALX3O95076 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALX3O95076 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALX3O95076 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALX3O95076 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ALX3O95076 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ALX3O95076 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ALX3O95076 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms