Protein–RNA interactions for Protein: O43734

TRAF3IP2, Adapter protein CIKS, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2O43734 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRAF3IP2O43734 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRAF3IP2O43734 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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TRAF3IP2O43734 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAF3IP2O43734 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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