Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDB2O43679 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDB2O43679 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDB2O43679 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDB2O43679 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDB2O43679 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDB2O43679 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDB2O43679 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDB2O43679 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDB2O43679 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDB2O43679 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LDB2O43679 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LDB2O43679 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LDB2O43679 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDB2O43679 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms