Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FOXO3O43524 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
FOXO3O43524 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms