Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
COCHO43405 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
COCHO43405 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COCHO43405 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COCHO43405 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
COCHO43405 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COCHO43405 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COCHO43405 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
COCHO43405 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
COCHO43405 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms