Protein–RNA interactions for Protein: O43255

SIAH2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIAH2O43255 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIAH2O43255 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms