Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CLDN25C9JDP6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms