Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERVV-2B6SEH9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ERVV-2B6SEH9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms