Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PALM2-AKAP2B1ALY0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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