Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PALM3A6NDB9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms