Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
KLHL33A6NCF5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL33A6NCF5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms