Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WT03

TRAV26-1, T-cell receptor alpha variable 26-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV26-1A0A087WT03 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TRAV26-1A0A087WT03 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms