Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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ARL2-SNX15V9GYD0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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ARL2-SNX15V9GYD0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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