Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GJA3Q9Y6H8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms