Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AUP1Q9Y679 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms