Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GTF3C3Q9Y5Q9 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms