Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TTF2Q9UNY4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TTF2Q9UNY4 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms