Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SNX12Q9UMY4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SNX12Q9UMY4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms