Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TRAPPC2LQ9UL33 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TRAPPC2LQ9UL33 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms