Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FBXO4Q9UKT5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms