Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms