Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
IFT172Q9UG01 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
IFT172Q9UG01 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms