Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CLIP2Q9UDT6 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CLIP2Q9UDT6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms