Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCHIP1Q9P0W5 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms