Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFA13Q9P0J0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms