Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HACD3Q9P035 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms