Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MIS18AQ9NYP9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MIS18AQ9NYP9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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