Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALKBH4Q9NXW9 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms