Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AC003986.3-201ENST00000417460 692 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AC090515.5-201ENST00000560378 526 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AC015849.4-201ENST00000603678 421 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PGPEP1Q9NXJ5 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms