Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CWC25Q9NXE8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CWC25Q9NXE8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms