Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NLE1Q9NVX2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NLE1Q9NVX2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms