Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SLC6A13Q9NSD5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms