Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SERINC1Q9NRX5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms