Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS2Q9NRF8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS2Q9NRF8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS2Q9NRF8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CTPS2Q9NRF8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms