Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CHST12Q9NRB3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHST12Q9NRB3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms